Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh8D3Z6W3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rdh8D3Z6W3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms