Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms