Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms