Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms