Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc13D3YV10 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms