Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms