Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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