Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71aB7XG49 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71aB7XG49 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms