Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms