Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms