Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usf3B2RUQ2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usf3B2RUQ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms