Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms