Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf518bB2RRE4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms