Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms