Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms