Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2012B1B0R1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms