Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trabd2bB1ATG9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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