Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem235B1AQL3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem235B1AQL3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms