Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skint8A7XV07 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms