Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatsperbA2RTF1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms