Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf39A2RT81 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf39A2RT81 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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