Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Lcn6A2AJB9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Lcn6A2AJB9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Lcn6A2AJB9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn6A2AJB9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms