Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc183A2AJB1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms