Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms