Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cdc27A2A6Q5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdc27A2A6Q5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms