Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo47A2A6H3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms