Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cul4bA2A432 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms