Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm3880A0A1B0GSB3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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