Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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