Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt16Q9Z2K1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt16Q9Z2K1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt16Q9Z2K1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt16Q9Z2K1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms