Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lgr5Q9Z1P4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lgr5Q9Z1P4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lgr5Q9Z1P4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lgr5Q9Z1P4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lgr5Q9Z1P4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lgr5Q9Z1P4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms