Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfrp4Q9Z1N6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp4Q9Z1N6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp4Q9Z1N6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 366.8 ms