Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sumo3Q9Z172 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sumo3Q9Z172 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sumo3Q9Z172 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sumo3Q9Z172 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms