Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmg20bQ9Z104 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hmg20bQ9Z104 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hmg20bQ9Z104 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hmg20bQ9Z104 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms