Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap4s1Q9WVL1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap4s1Q9WVL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap4s1Q9WVL1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4s1Q9WVL1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms