Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn5Q9WVD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn5Q9WVD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn5Q9WVD4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcn5Q9WVD4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms