Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NbnQ9R207 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NbnQ9R207 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NbnQ9R207 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NbnQ9R207 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms