Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubd1Q9R1K7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubd1Q9R1K7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubd1Q9R1K7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubd1Q9R1K7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms