Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpxQ9R0M3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpxQ9R0M3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrpxQ9R0M3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpxQ9R0M3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms