Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp11cQ9QZW0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11cQ9QZW0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11cQ9QZW0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11cQ9QZW0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms