Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp21Q9QZL6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp21Q9QZL6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp21Q9QZL6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp21Q9QZL6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp21Q9QZL6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms