Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd4Q9QY39 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd4Q9QY39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd4Q9QY39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd4Q9QY39 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms