Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp3Q9QY23 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp3Q9QY23 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp3Q9QY23 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms