Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip4Q9QXN3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trip4Q9QXN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip4Q9QXN3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip4Q9QXN3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip4Q9QXN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms