Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf3Q9QXK7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf3Q9QXK7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms