Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ChmQ9QXG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ChmQ9QXG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChmQ9QXG2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChmQ9QXG2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ChmQ9QXG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.8 ms