Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdkl2Q9QUK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkl2Q9QUK0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl2Q9QUK0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl2Q9QUK0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms