Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm1Q9JLF6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Tgm1Q9JLF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm1Q9JLF6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tgm1Q9JLF6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tgm1Q9JLF6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Tgm1Q9JLF6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Tgm1Q9JLF6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Tgm1Q9JLF6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm1Q9JLF6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm1Q9JLF6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms