Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrac1Q9JKP8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrac1Q9JKP8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrac1Q9JKP8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrac1Q9JKP8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrac1Q9JKP8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms