Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN5

Olig1, Oligodendrocyte transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olig1Q9JKN5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Olig1Q9JKN5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Olig1Q9JKN5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Olig1Q9JKN5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Olig1Q9JKN5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms